So wie ich den Workflow von @Biker verstehe geht des darum, die Shapingpoints zu entfernen und nur die Viapoints zu erhalten und diese als <wpt> zusammen mit dem Track als GPX zu exportieren.
Wenn das korrekt ist, dann gibt es dazu bereits einen Vorschlag.
EDIT: gemeint ist damit nicht, dass die Shapingpoints (<trkpt>) aus dem <trk> entfernt werden; es geht nur darum, dass sie nicht zusätzlich als <wpt> exportiert werden.