Schau mal den Thread. Da ist auch die App erwähnt.
Ich dachte, die gpx, welche Du kombinierst enthalten nur Tracks, oder auch Routen?
Wenn sowohl Route als auch Track in den Ausgangsdateien sind, gibt es die Möglichkeit im Overlay Wegpunkte als auch Routen abzuwählen. Dann sind die Verbindungslinien weg.
Oder die werden schon bei Konvertierung per Skript aussortiert.
Wäre ein Versuch wert?